祈錦鈅已于近期离开台湾，长期定居上海，并与两位合伙人共同经营一家医美诊所，承担诊所的营运与沟通工作，同时向团队传达台湾人的自然审美偏好 [1, 2, 3, 4]。她表示生活重心现在放在上海，喜欢当地充满活力、快节奏的生活，“我喜欢那边生机勃勃的感觉，速度很快，不会纠结于很小的事情。”她的作息规律，大约是早上9点到下午5点 [1, 5, 3, 4]。

虽然过去支持自然派外型，祈錦鈅近来也亲自尝试医美疗程，调整眉弓和脸颊。她坦言术后脸部肿胀，曾自嘲“前几天打完，我脸肿成猪，我看着镜子想说，该不会没办法恢复原状了吧？很像食蚁兽。” [1, 2, 5, 6, 3, 7, 4]。她曾幽默回应合伙人吐槽她胸部太大，容易吸引色狼的注意时说，“色狼也会爱漂亮。” [1, 5, 6, 3, 7, 4]

祈錦鈅2023年闪婚圈外男友，同年底赴加拿大产下一女，2025年底宣布离婚，目前孩子主要由前夫照顾，她通过视讯保持联系，形容孩子性格独立 [2, 5, 6, 7, 4]。感情方面，她表示目前单身，几乎没有时间谈恋爱，“以前会想像白马王子的剧情，但现在就不会了。” [1, 2, 5, 6, 7, 4]

她同时相当重视隐私安全，对医美偷拍案件保持警惕，称自己“有点神经质，到新的地方都会看一下，很注重隐私。” [1, 2, 5, 6, 7]

虽然人物主要生活在上海，但祈錦鈅尚未完全淡出演艺圈，她计划未来持续在上海的Live House进行表演 [1, 5, 3, 7, 4]。5月14日，她出席好友阜东昇的发片记者会，公开自己已定居上海及医美诊所合伙人的身份 [2, 5, 6, 3, 7, 4]。