2023年3月，京都同志社国际高中的学生在冲绳县名护市边野古预定的美军基地迁建地点附近，乘坐抗议船时发生倾覆事故，造成一名女高中生和一名船长死亡 [1, 2]。事故中的船长参与抗议活动，并受学校支付费用为学生运营该抗议船。2023年该船长共为该校运营了6次船只，但未按日本《海上运输法》登记乘客信息 [1, 2]。
日本文部科学省经过调查后认定，同志社国际高中此次校外教学活动违反《教育基本法》中关于政治中立的规定。文科省指出，课堂主要目的为参访反对美军基地迁建的地点，学校未能呈现多元观点，偏向单一立场，内容存在政治倾向性。同时，学校在乘船前未进行安全检查，属于极其不当的安全管理 [1, 2]。这是自2006年《教育基本法》实施以来，首次有学校被判定违反政治中立条款。
文科省部长松本洋平批评部分教师“明知船长日常从事抗议活动，且乘坐的船属于抗议船，仍持续组织行程” [1]。冲绳综合事务局随即以违反《海上运输法》对已故船长提出刑事控诉 [1, 2]。国土交通省也对船只事故展开调查 [1, 2]。
同志社国际高中回应称，校方“认真看待文科省的见解，目前正在评估”相关情况 [1]。目前有关部门已责令学校进行整改，事件后续处理仍在进行中。
