花莲经济部水利署第九河川局正在马太鞍溪沿岸建设高规格堤防和第二道防线堤防，以防止未来洪灾发生，相关工程于2025年12月开始进行堤坝沉淀物清理作业，2026年1月25日完成堤坝体挖掘作业，预计建设完成后堤坝蓄水量约5,000立方米 [1, 2, 3]。
该防洪工程涉及河岸周边土地征收，引发当地土地所有人及农户的强烈反弹。当地北岸综合开发区的农民抗议水利署牺牲农民权益，指责对佃农的补偿不公平，租种农户李建英表示：“水利署只提到地主的协商价购，却没补偿佃农的资金投入，希望水利署听到卑微小农民的心声，至少可以等到7月底高粱收割” [3]。
2026年5月27日，政府在光复乡举办首次公开听证会，现场地主意见分歧，对工程诉求各异 [1, 2]。水利署第九河川局局长吴明华回应：“后续北岸综开段也会举办公听会，用地也将优先向地主协议价购。”他补充，针对佃农因土地征收受损的补偿，署方将根据地主提供的租赁协议进行赔偿 [3]。
马太鞍溪水库堤坝体、塌陷区及中上游河道尚有约2.4亿立方米沉积物残留，存在地震或强降雨时形成新坝湖并可能溃坝的风险。行政院在2026年5月26日召集大学学者及水利、土木和地质专家召开上游治理策略专家会议以讨论对策 [1, 2, 3]。
目前清淤工作包括于2025年干旱季节进行的堤坝体沉积物挖掘，坡面切割、沟渠控水和坡面排水等防汛前准备工作，以及中游设置临时沉积物控制设施 [1, 2, 3]。专家普遍认为兴建上游施工便道是必要的，但便道须加固以抵抗台风和暴雨侵袭。“与会专家学者普遍认为开设施工便道仍属必要，但须加强维护防颱风豪雨破坏，”专家表示 [1]。
目前，水利署针对北岸综合开发段的征地计划预计将于2026年6月与私人土地所有者签订土地征用协议 [3]。
