赖清德总统提名徐锡祥担任检察总长，遭立法院以61票反对、50票赞成的结果否决 [1, 2, 3]。尽管如此，赖清德于2026年5月8日任命徐锡祥为代理检察总长，确保司法机关重要职能持续运作 [4, 3, 5, 6, 1, 7, 8, 2, 9]。徐锡祥表示，“最高检察署有一个很重要的功能，就是非常上诉，这个机制不能停，我是奉命来代理这项职务” [2]。
徐锡祥于5月8日代理上任，接替于5月7日任期届满的前检察总长邢泰钊 [5, 7, 9]。他已批准数起关键非常上诉案件，显示代理期间持续行使职权 [9]。
此次代理任命引起岛内政坛与司法改革团体的强烈争议。反对党及民间司法改革基金会批评，这种未经立法院同意而任命被否决人选代理检察总长，形同削弱国会人事同意权，损害民主基石 [4, 3, 1, 2, 9]。基金会呼吁赖总统撤回相关成命，并强调立法院已明确否决徐锡祥，任命代理“完全无视国会审查结果” [4, 9]。
民进党立法院党团则回应，否决行动具政治动机，尊重制度且依法进行，任命符合法律规定并保障司法功能的连续性 [9]。依据法院组织法第66条，检察总长职位空缺时，总统应三个月内重新提名 [5, 7]。过往调查局长曾代理检察总长，且未遭立法院否决，代理任期也未超过三个月 [5]。
2026年5月19日，立法院对赖清德进行总统弹劾投票，因未达到门槛而未通过，显示政治局势仍紧张 [4, 3, 5, 6, 7]。同日，徐锡祥在海巡署记者会上公开表示，将依命履责，维持重要司法机制不中断 [5, 6, 1, 7, 8, 10, 2, 9]。
赖清德政府在5月18日公布的DPP民调中，政绩满意度56.4%，个人信任度51.8%，维持五成以上支持 [4, 3, 1]。但反对者指责其“绿色威权”，批评其绕过立法机关，影响司法独立 [4, 3]。
